[特邀报告]“女娲”基因组资源之中国人群微卫星变异图谱

“女娲”基因组资源之中国人群微卫星变异图谱
特邀报告

报告开始:5月14日 14:40:00 (Asia/Shanghai)

报告时间:20min

所在会议:[S4] 分会场四 [S4-2] 系统生物学、群体遗传学与分子进化

摘要
微卫星(也称为短串联重复序列,STR)是1–6个碱基对的串联重复序列,约占人类基因组的3%,相比简单变异具有更加复杂的变异和更高的突变率,分析难度更大。大量多态性STR已被发现可以调节各种分子和细胞过程,约60个STR位点已被发现与人类孟德尔疾病有关,揭示多态性STR对人类疾病和复杂性状的贡献具有重要意义。然而,目前对于STR变异的分析仍很不完备,更是缺少对中国人群的大规模研究。为此,研究团队基于“女娲”中国人群基因组资源和千人基因组数据共约6500例,构建了包含366,013个多态性STR位点的全基因组STR变异图谱,并对STR的基因组分布、突变特征、功能影响、基因调控效应、人群特征与人群差异等进行了系统分析,构建了一个全面的STR变异资源库。该工作是目前国际上包含中国人群数目最多(包括约4000例“女娲”中国人群基因组数据)的全球STR变异研究,对人类基因组中STR变异的多样性和潜在功能提供了新的见解,为未来STR相关的研究提供了参考与基础。 “女娲”基因组资源将服务于中国人群的疾病队列研究,助力中国人群的精准医学研究和转化。
报告人
何顺民
研究员 中科院生物物理所

何顺民博士毕业于中科院生物物理所,生物信息学专业,并在哈佛大学医学院完成博士后研究。现任中科院生物物理所研究员,健康大数据研究中心常务副主任,中国科学院大学教授,博士生导师。从事生物信息学和生物大数据分析近20年,开发算法、软件和数据库30多个,发表论文50多篇。围绕“女娲”(NyuWa)中国人群基因组计划,构建了高深度测序的中国参考人群队列;发布了中国参考人群 SNP/Indel变异图谱和单倍型参考面板;解析了含中国人群数目最多的全球移动元件变异图谱和全球微卫星变异图谱;聚焦复杂非编码区域功能解析,开发并维护着国际权威的非编码知识库NONCODE、NPInter、piRBase和SmProt等。作为课题负责人承担过973、863、精准医学重点研发专项、中科院先导专项、国家自然科学基金等项目。