Copyright © 第九届全国计算生物与生物信息学大会
Powered by 徐州医科大学
专题2_墙报展示_傅萍_从small RNA-Seq数据中系统地鉴定和描述病毒小RNA
报告开始：5月13日 11:40:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：10min
所在会议：[E] 墙板报告 [E-1] 张贴墙板报告
摘要
目前仍然缺乏对病毒小RNA的系统性描述和资源储存。在此，我们从800多个公共的小RNA-Seq样本中，在64个病毒物种中共鉴定了19,734个高置信度的病毒小RNA（vsRNAs），包括2746个miRNAs。vsRNAs的长度主要分布在21和22 nt。与动物病毒相比，植物病毒表达的vsRNAs数量更多，水平更高。有趣的是，vsRNA表现出很强的表达特异性，在病毒的不同毒株中很少观察到有重叠的vsRNAs。为了方便使用vsRNAs，我们建立了一个名为vsRNAdb的数据库，用于组织和存储vsRNAs。