Copyright © 第九届全国计算生物与生物信息学大会
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生物序列优化的计算策略及在疫苗设计中的应用
特邀报告
报告开始：5月13日 14:40:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[S1] 分会场一 [S1-1] 精准医学与转化医学信息学
摘要
自然界中目前存在或发现的生物分子（如酶、多肽和核酸等）的某些关键性质往往不能满足实际的工业或医疗应用需求。本报告将首先介绍生物分子序列改造或优化中常用的计算策略，如理性设计、定向进化、机器学习等，然后介绍基于Transformer的深度学习方法在pHLA（人类白细胞抗原-多肽）结合亲和力预测、多肽疫苗的抗原序列优化等任务中开发的计算框架及研究进展。
报告人
熊毅
副研究员 上海交通大学熊毅，副研究员，现任职于上海交通大学生物信息学与生物统计学系（2014年-），上海人工智能实验室顾问科学家（2022年-）。本硕博毕业于武汉大学计算机学院（2002-2011年），曾在美国普渡大学生物学系从事博士后研究（2012-2013年）。研究方向包括：人工智能（机器学习）；蛋白序列-功能关系建模；蛋白（多肽）、药物分子智能设计等。在Nature Machine Intelligence等期刊共发表论文60余篇。