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胰腺癌基因表达去卷积方法的综合评价
报告开始：5月13日 14:50:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：10min
所在会议：[E] 墙板报告 [E-1] 张贴墙板报告
摘要
既往研究使用多个公开数据集和评估指标对不同去卷积工具的性能进行了测评，发现不同工具在不同数据集和评估指标下表现不同，并且这些工具的准确性会受到许多因素的影响，例如数据标准化策略、细胞类型标记选择、去卷积算法和参考数据集等。这表明没有一种通用的去卷积方法适用于所有数据类型和组织类型，而需要根据具体情况选择最适合的方法。由于不同的细胞类型在不同的组织中可能具有不同的基因表达模式，因此去卷积结果可能会受到组织特异性的影响。本项目以胰腺癌为例，选择近几年比较具有代表性的去卷积方法和工具，对胰腺癌基因表达去卷积进行系统性比较和评估，通过整合多个scRNA-seq数据集构建胰腺癌去卷积单细胞参考图谱，并实现一个针对胰腺癌的用户友好型去卷积网页工具。