Copyright © 第九届全国计算生物与生物信息学大会
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泛癌分析揭示肿瘤微生物组与宿主分子异常间的关联
特邀报告
报告开始：5月13日 15:40:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[S2] 分会场二 [S2-1] 基因组学、表观基因组学和微生物组学
摘要
宿主-微生物互作在癌症生态系统中发挥关键作用，但尚未在泛癌症和多组学水平上被系统研究。通过TCGA的近万例样本，我们系统研究肿瘤微生物与肿瘤微环境、表观遗传组、转录组和蛋白质组之间的关联，最终发现多种癌症中肿瘤微生物与宿主分子异常之间的超80万个候选关联。我们发现：除了癌症类型特异性关联外，微生物与肿瘤微环境间存在泛癌症关联，并从其他数据中得到验证；中介分析发现某些微生物和基因表达间的关联可能由DNA甲基化介导；生存分析发现上述微生物或影响患者的生存。最后，我们构建了MOMAC数据库用于后续探索。
报告人
帅世民
研究员 南方科技大学帅世民，南方科技大学医学院副教授（研究员）、博士生导师，国家首批“海外优青”、深圳国家领军人才。2014年本科毕业于浙江大学，2019年博士毕业于多伦多大学，后赴欧洲分子生物学实验室（EMBL）进行博士后研究， 2021年秋季全职回国组建课题组。主要从事生物信息学、癌症多组学等领域的研究。其与癌症基因组学、计算组学工具研发等相关的研究成果发表在了Nature及其子刊上，论文总被引超过2000次，h-index为10（Google Scholar，2022.11）。主持多项国自然科研项目。