Copyright © 第九届全国计算生物与生物信息学大会
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剪接异构体全长的识别与定量
特邀报告
报告开始：5月14日 15:00:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[S2] 分会场二 [S2-2] 高通量测序与生命组学大数据
摘要
本研究介绍了一种新型计算工具ESPRESSO, 可直接对高测序错误率的长读长RNA测序数据进行更准确的转录本分析。ESPRESSO 综合考虑每个基因所有的长读长RNA测序序列信息，同时根据每条序列和基因组的比对情况以及序列错误模式，来改进剪接点的识别以及全长转录本的发现和定量。此外，研究团队还使用牛津纳米孔平台对三十种人类组织和三种人类细胞系进行测序，生成并分析了超过10亿条的长读长RNA测序序列，为研究人类转录组变异提供了新的资源。我们期望ESPRESSO成为探索转录组变异及调控的有力工具。
报告人
高远
研究员 中科院北京基因组所（国家生物信息中心）高远，中国科学院北京基因组研究研究员、博士生导师。近年来，围绕生物高通量测序数据相关的特征识别和精准定量算法开发及分析，取得了多项重要进展，已先后在Nature Methods，Science Advances，Genome Biology，Nature Communications，Trends in Genetics，Briefings in Bioinformatics等国际期刊上以第一或通讯作者发表生物信息学、微生物组学及转录组学等方向论文。开发的CIRI系列等多款生物信息学算法获得广泛应用。