[特邀报告]钾通道结构与功能的分子模拟研究

钾通道结构与功能的分子模拟研究
特邀报告

报告开始:5月13日 15:00:00 (Asia/Shanghai)

报告时间:20min

所在会议:[S3] 分会场三 [S3-1] 结构生物信息与药物分子设计

摘要
钾通道是很多疾病的药物靶点,研究其门控机制能指导理性化药物设计。然而钾通道存在多个门控,他们协同作用,并受到周围膜环境的影响,其机制相对复杂。我们采用分子动力学模拟,首先研究了膜环境对钾通道结构与功能的影响。通过构建十余种不同的脂双层膜,我们观测到膜的理化性质通过改变蛋白构象平衡影响蛋白功能,在此过程中,不同门控的耦合对调控离子流动速率起到了关键作用[1]。在此基础上,我们进一步研究了以上观测到的中央空腔的疏水门控的工作机制,通过增强采样方法,评估了中央空腔的溶剂化程度对蛋白功能的影响,并通过中央空腔的去溶剂化成功诱导了通道开关的构象变化[2]。此外,我们还对中央空腔开关过程中的磷脂-蛋白相互作用进行了系统采样,阐明了磷脂在中央空腔开关过程中的关键作用。最后,我们对几种代表性的钾通道进行了系统的分子动力学模拟,证明了不同门控的耦合机制在不同钾通道中广泛存在。我们的研究初步阐明了复杂膜环境中,钾通道受调控的物理化学行为,特别是其门控的工作机制,为设计以钾通道为靶点的药物,提供了理论支撑。
报告人
顾若虚
副教授 上海交通大学 生物信息与生物统计系

长聘 教 轨 副教授,上海交通大学生物信息与生物统计系 ,研究领域分子动力学模拟,理性药物设计, 离子通道,蛋白-磷脂相互作用,膜生物物理 承担项目 2023.01- - 2026.12 国家自然科学基金面上项目(项目批准号 32271291),主持 2022.08- - 2027.07 科技创新 2030-脑科学与类脑研究重大项目(项目编号 2022ZD0207400),青年 项目子任务负责人 2021.12- - 2026.11 国家重点研发计划(项目编号 2021YFA0911500),青年项目子任务负责人 2021.10- - 2023.09 上海市浦江人才计划(项目编号 21PJ1405100), 主持 2022.01- - 2024.12 国家自然科学基金青年项目(项目批准号 22107070), 主持