AlphaFold2 在蛋白质结构预测方面的最新进展为从结构生物学角度解读生物功能开辟了新的途径，也给生物信息学和系统生物学带来了极大的挑战和机遇。蛋白质的功能不仅仅取决于蛋白质的结构，更重要的是由其动力学性质所决定，所以如何在蛋白质组学的水平上去解读蛋白质动力学，对于预测和理解蛋白质的功能位点非常关键。生物网络的方法为从蛋白质组学水平研究蛋白质的结构和功能提供了计算和建模框架。在本次报告中，我们将首先简单介绍两种基于蛋白质结构和动力学的网络模型：蛋白质结构网络和弹性网络模型[1]。然后，将进一步介绍两个应用案例，既如何利用基于蛋白质结构网络和弹性网络模型的分子指标计算，用于错义突变的预测以及进一步理解基因型-表型的别构基础 [2]；研究翻译后修饰（PTM)位点的动力学，以及针对靶向功能PTM的药物设计研究 [3]。