Copyright © 第九届全国计算生物与生物信息学大会
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基于有监督语言模型的单序列蛋白质结构预测
口头报告
报告开始：5月13日 17:35:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：15min
所在会议：[S3] 分会场三 [S3-1] 结构生物信息与药物分子设计
摘要
近年来，AlphaFold2等算法的出现将蛋白质结构预测提升到了接近于实验解析的精度。然而，这类方法需要依赖于由同源序列构成的多重序列比对(MSA)，而只使用序列本身预测蛋白质结构仍具有挑战性。为了解决这个问题，我们开发了trRosettaX-Single，一种用于单序列蛋白质结构预测的自动化算法。trRosettaX-Single在孤儿蛋白上的表现优于AlphaFold2和RoseTTAFold，并对于人工设计蛋白也实现了很高的精度。我将对这个算法进行介绍。
报告人
王文恺
博士研究生 南开大学南开大学数学科学学院2020级博士生，导师为杨建益教授，主要研究方向为人工智能在结构生物信息学中的应用，开发了trRosettaX、trRosettaX-Single以及trRosettaRNA等一系列结构预测算法，目前已在Nature Computational Science、Nature Protocols、Advanced Science等期刊发表论文五篇。