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谱系示踪整合单细胞组学解析造血分化及细胞命运决定
特邀报告
报告开始：5月14日 14:40:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：20min
所在会议：[S3] 分会场三 [S3-2] 单细胞组学技术开发与应用
摘要
谱系示踪可用于揭示干细胞命运，确定体内细胞谱系。为此，我们开发了一种非侵入式、基于内源遗传的谱系示踪Polylox细胞条码系统，其中利用长达2Kb的DNA片段随机重组可产生多达180万种遗传条码。通过三代长度长测序技术读取DNA序列，我们发展了细胞条码解码算法，计算了各种条码的生成概率。应用该系统，我们重构了小鼠造血谱系。为在同一细胞中同时获取细胞命运和转录组的信息，我们继续开发了PolyloxExpress系统。将细胞命运与造血干细胞转录组学相联系，我们揭示了分化不活跃、分化谱系受限、可分化为全谱系的造血干细胞克隆具有较明显的差异。目前，我们仍在开发谱系示踪整合单细胞多组学的技术。这些方法将为解析干细胞命运决定的分子机制铺平道路。
报告人
王曦
教授 南京医科大学王曦，博士、教授、博士生导师，现任南京医科大学生殖医学与子代健康全国重点实验室PI，江苏特聘教授，江苏省医疗卫生创新团队领军人才。 2011 年于清华大学获工学博士学位；2011 至 2020 年赴澳大利亚纽卡斯尔大学、德国马克斯德尔布吕克分子医学中心（MDC）、德国国家癌症研究中心（DKFZ）从事生物医学科研工作。迄今以通讯、第一作者（含共同）在Cell Stem Cell、Immunity、Nat Methods、Nat Commun、Nucleic Acids Res 等国际著名期刊上发表SCI论文21 篇，共发表 SCI 论文38 篇，总被引用 6000余次，H指数为25。目前担任中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会委员，中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员，中国计算机学会生物信息学专业委员会通讯委员，Military Medical Research中国卓越期刊青年编委等。