Copyright © 第九届全国计算生物与生物信息学大会
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scBC: 单细胞RNA-seq数据中的贝叶斯双聚类
口头报告
报告开始：5月14日 16:50:00 （Asia/Shanghai）
报告时间：15min
所在会议：[S3] 分会场三 [S3-2] 单细胞组学技术开发与应用
摘要
网络生物标志物被认为比单个分子生物标志物更能用于疾病表征。它们通常是细胞特异性的，并随着复杂疾病的进展而变化。在这里，我们提出了一个单细胞贝叶斯双聚类（scBC）框架，用于scRNA-seq数据中网络基因生物标志物的细胞特异性检测。据我们所知，我们是第一个利用双聚类方法在单细胞水平上分析复杂疾病功能基因模块中的扰动的人。通过将我们的框架应用于scRNA-seq阿尔茨海默病（AD）数据，我们可以揭示不同细胞组下功能基因模块的扰动，并揭示AD进展过程中基因与细胞的相关性。
报告人
张岳
副研究员 上海交通大学张岳，博士，现任上海交通大学生物信息学与生物统计学系副研究员, 上海交通大学转化医学研究院生物医学数据技术中心副主任。主持国家自然科学基金，上海市哲学社会科学基金。发表SCI文章40余篇，担任世界中医药联合会临床科研统计学专业委员会理事、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员。