[特邀报告]转录调控决定细胞命运的生物信息学研究

转录调控决定细胞命运的生物信息学研究
特邀报告

报告开始:5月13日 14:00:00 (Asia/Shanghai)

报告时间:20min

所在会议:[S4] 分会场四 [S4-1] 基因表达调控与大分子修饰

摘要
细胞作为高等生物的基本结构和功能单位,其命运决定的调控机制是个体发育与肿瘤研究领域最为关键科的生命学问题,与之相对应的关键信息科学问题则是深度挖掘与解析海量高维的生物数据。为此,报告人近年来紧紧围绕国家重大研究计划有关“生物与信息融合(BT&IT)” 及干细胞的关键技术和科学问题,聚焦转录调控这一重点领域,整合多组学高通量测序数据,长期致力于细胞命运决定的生物信息学研究。本次报告将简要介绍本研究团队针对以上科学问题,在开发新算法、构建新模型、发现新机制方面所做的系列工作,主要包括:(1)针对基因转录与可变剪接的多重调控模式,开发新算法解决多重网络构建与调控模块识别问题;(2)整合可变剪接调控的遗传因素与表观遗传修饰,构建新模型破译可变剪接的时空特异性表达模式和(表观)遗传密码;(3)应用以上算法与模型于干细胞分化过程,发现新机制揭示细胞命运决定的关键可变剪接基因及其表观遗传调控机制。
报告人
徐云刚
教授 西安交通大学

徐云刚,西安交通大学医学部基础医学院教授、博士研究生导师,青年拔尖人才,陕西省秦创原引用高层次创新创业人才,西安交通大学党委政策研究室副主任(挂职)。2014年博士毕业于哈尔滨工业大学生命学院和计算机学院,随后在美国Wake Forest School of Medicine、UT Health和University of Pennsylvania任职博士后、讲师和研究助理教授,2021年3月全职回国任现职。研究领域为生物信息学与多组学,主要方向包括细胞命运决定的基因转录调控、计算表观遗传学与空间基因组、单细胞多组学整合与机器学习。主持国家级、省部级和校级项目多项,担任5个学会生物信息学专业委员会委员、10余个国际SCI期刊编辑国际会议程序委员,曾获得教育部、省级和厅级奖励各1项,在SCI期刊发表论著近30篇,授权发明专利3项。