非编码RNA（ncRNA）一直被认为不具备编码能力，仅能通过自身序列或结构发挥调控功能。然而，随着核糖体测序技术的出现和发展，非编码RNA同样被发现存在核糖体翻译信号。质谱实验则进一步证实，非编码RNA可以翻译产生长度小于100个氨基酸的微蛋白。近来越来越多的证据表明，微蛋白在多种生物学过程中发挥着重要作用，并与多种人类疾病密切相关。目前，非编码RNA中编码微蛋白区域（csORF）的鉴定仍具有挑战性，并且其翻译调控机制也尚不清楚。鉴于此，我们提出了一种新的基于胶囊神经网络模型的计算识别方法csORF-finder，其在微蛋白编码区域识别的准确率、敏感性等方面均显著优于其他方法，并在多个物种上表现出良好的泛化能力。此外，我们对质谱实验证实的可编码微蛋白的lncRNA进行了深入分析，挖掘其与翻译调控相关的序列及结构特征，发现内部核糖体进入位点（IRES）及m7G修饰对lncRNA的编码能力至关重要。最后，针对IRES元件，整合转录组及翻译组测序数据，从翻译失调及反式作用因子互作的角度计算识别出17个肝细胞癌中活性异常的IRES元件，或可作为新型生物标志物。